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Le Microbiome : L’équilibre du corps humain dépend du microbiote

Dans cet article, Détox au Naturel aborde le microbiome. Imaginez une ville animée un matin de semaine, les trottoirs inondés de gens se précipitant pour se rendre au travail ou à des rendez-vous. Imaginez maintenant cela à un niveau microscopique et vous avez une idée de ce à quoi ressemble le microbiome à l’intérieur de notre corps, composé de milliards de micro-organismes de milliers d’espèces différentes. 

Ceux-ci incluent non seulement les bactéries, mais aussi les champignons, les parasites et les virus. Chez une personne en bonne santé, ces “insectes” coexistent pacifiquement. Le plus grand nombre se trouvant dans l’intestin grêle et le gros intestin mais aussi dans tout le corps.

Le microbiome est qualifié d’organe de soutien car il joue de nombreux rôles clés dans le bon fonctionnement quotidien du corps humain

Le microbiome est qualifié d'organe de soutien car il joue de nombreux rôles clés dans le bon fonctionnement quotidien du corps humain

Chaque personne possède un réseau de microbiote tout à fait unique qui est à l’origine déterminé par son ADN. Une personne est d’abord exposée à des micro-organismes en tant que nourrisson, lors de l’accouchement dans le canal de naissance et par le lait maternel.  Les micro-organismes auxquels le nourrisson est exposé dépendent uniquement de l’espèce trouvée chez la mère. Plus tard, les expositions environnementales et le régime alimentaire peuvent modifier le microbiome d’une personne pour qu’il soit bénéfique pour la santé ou l’exposer à un risque accru de maladie.

Le microbiome se compose de microbes qui sont à la fois utiles et potentiellement nocifs. La plupart sont symbiotiques, C’est-à dire nécessaire pour le bon fonctionnement du corps. Puis certains, en plus petit nombre, sont pathogènes favorisant la maladie. Dans un corps sain, microbiote pathogène et symbiotique coexistent sans problème. Mais s’il y a une perturbation de cet équilibre – provoquée par des maladies infectieuses, certains régimes ou l’utilisation prolongée d’antibiotiques ou d’autres médicaments destructeurs de bactéries – une dysbiose se produit, arrêtant ces interactions normales. En conséquence, le corps peut devenir plus sensible aux maladies.

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Comment le microbiome profite au corps

Comment le microbiote profite au corps

Le microbiote stimule le système immunitaire, décompose les composés alimentaires potentiellement toxiques et synthétise certaines vitamines et acides aminés,  y compris les vitamines B et la vitamine K. Par exemple, les enzymes clés nécessaires à la formation de la vitamine B12 ne se trouvent que dans les bactéries, pas chez les plantes et les animaux.

Les sucres comme le sucre de table et le lactose sont rapidement absorbés dans la partie supérieure de l’intestin grêle, mais les glucides plus complexes comme les amidons et les fibres ne sont pas aussi facilement digérés et peuvent se déplacer plus bas dans le gros intestin. Là, le microbiote aide à décomposer ces composés avec leurs enzymes digestives.

La fermentation des fibres non digestibles provoque la production d’acides gras à chaîne courte qui peuvent être utilisés par l’organisme comme source de nutriments mais jouent également un rôle important dans la fonction musculaire et éventuellement la prévention de maladies chroniques, dont certains cancers et troubles intestinaux . Des études cliniques ont montré que les acides gras à chaîne courte peuvent être utiles dans le traitement de la colite ulcéreuse, de la maladie de Crohn et de la diarrhée associée aux antibiotiques.

Le microbiote d’une personne en bonne santé fournira également une protection contre les organismes pathogènes qui pénètrent dans le corps, par exemple en buvant ou en mangeant de l’eau ou des aliments contaminés.

Les grandes familles de bactéries présentes dans l’intestin humain comprennent Prevotella, Ruminococcus, Bacteroides et Firmicutes.  Dans le côlon, un environnement pauvre en oxygène, vous trouverez les bactéries anaérobies Peptostreptococcus, Bifidobacterium, Lactobacillus et Clostridium.  On pense que ces microbes empêchent la prolifération de bactéries nocives en rivalisant pour les nutriments et les sites de fixation aux muqueuses de l’intestin.

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Le rôle des probiotiques

Si le microbiote est si vital pour notre santé, comment pouvons-nous nous assurer que nous en avons suffisamment? Vous connaissez peut-être les probiotiques ou les utilisez peut-être déjà. Il s’agit soit d’aliments contenant naturellement du microbiote.

Les recherches publiées sont contradictoires. Il existe des situations spécifiques où les suppléments probiotiques peuvent être utiles. Vous pouvez influencer plus efficacement cet énorme processus de colonisation bactérienne avec des probiotiques pendant ces périodes. Des situations de stress pour le corps où les probiotiques peuvent être utiles, comme :

  • la réduction de la gravité de la diarrhée après une exposition à des agents pathogènes
  • ou la reconstitution des bactéries normales dans l’intestin après qu’un patient a utilisé des antibiotiques.

Pourtant, ce sont toutes des circonstances où il y a une perturbation de l’équilibre dans l’intestin. Si vous avez affaire à un adulte en bonne santé ou à un enfant plus âgé qui ne prend pas d’antibiotiques, donner un probiotique sera aussi efficace pour améliorer sa santé en général.

L’alimentation peut-elle affecter son microbiome ?

En plus des gènes familiaux, de l’environnement et de l’utilisation de médicaments, l’alimentation joue un rôle important dans la détermination des types de microbiote vivant dans le côlon.  Tous ces facteurs créent un microbiome unique d’une personne à l’autre. Une alimentation riche en fibres affecte en particulier le type et la quantité de microbiote dans les intestins. Les fibres alimentaires ne peuvent être décomposées et fermentées que par des enzymes du microbiote vivant dans le côlon.

Les acides gras à chaîne courte sont libérés à la suite de la fermentation. Cela abaisse le pH du côlon. Ce qui à son tour détermine le type de microbiote présent qui survivrait dans cet environnement acide. Le pH plus bas limite la croissance de certaines bactéries nocives comme Clostridium difficile. La recherche croissante sur les acides gras à chaîne courte explore leurs effets étendus sur la santé. Notamment la stimulation de l’activité des cellules immunitaires et le maintien de taux sanguins normaux de glucose et de cholestérol.

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Les aliments qui soutiennent des niveaux accrus d’acides gras à chaîne courte sont:

  • Inuline
  • Amidons résistants
  • Gommes
  • Pectines 
  • Fructo-oligosaccharides

Ces fibres sont parfois appelées prébiotiques car elles nourrissent notre microbiote bénéfique.

Probiotiques et prébiotiques

Bien qu’il existe des suppléments contenant des fibres prébiotiques, il existe de nombreux aliments sains contenant naturellement des prébiotiques. Les quantités les plus élevées se trouvent dans les versions crues des éléments suivants :

  • Ail
  • Oignons
  • Poireaux
  • Asperges
  • Topinambours
  • Feuilles de pissenlit
  • Bananes
  • Algues

En général, les fruits, les légumes, le blé, l’avoine et l’orge sont tous de bonnes sources de fibres prébiotiques. Sachez qu’une consommation élevée d’aliments prébiotiques, surtout s’ils sont introduits soudainement, peut augmenter la production de gaz (flatulences) et les ballonnements. Les personnes souffrant de sensibilités gastro-intestinales telles que le syndrome du côlon irritable doivent introduire ces aliments en petites quantités pour d’abord évaluer leur tolérance. Avec une utilisation continue, la tolérance peut s’améliorer avec moins d’effets secondaires.

Si l’on n’a pas de sensibilités alimentaires, il est important de mettre en place progressivement un régime riche en fibres. Un régime pauvre en fibres peut non seulement réduire la quantité de microbiote bénéfique, mais aussi augmenter la croissance de bactéries pathogènes.

Les aliments probiotiques contiennent un microbiote vivant bénéfique qui peut altérer davantage le microbiome. Ceux-ci incluent des aliments fermentés comme le kéfir, le yaourt avec des cultures actives vivantes, les légumes marinés, le tempeh, le thé kombucha, le kimchi, le miso et la choucroute.

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